# 生信入门课程 v2 的依赖（2026-09-27 在 Python 3.13.5 / Windows 上验证通过）
# 安装：.venv\Scripts\python.exe -m pip install -r requirements.txt

# 实验 1：序列
biopython==1.88

# 数据处理与绘图（全部实验）
numpy==2.5.3
pandas==3.0.6
scipy==1.18.1
matplotlib==3.11.2
seaborn==0.13.2
scikit-learn==1.9.1

# 实验 2：差异表达
pydeseq2==0.5.4

# 实验 3：富集分析（GSEA）
gseapy==1.3.1

# 实验 4：单细胞
scanpy==1.12.4
anndata==0.13.4
igraph==1.0.0
leidenalg==0.12.0

# 判分与交互
pytest==9.1.1
jupyterlab==4.6.4
ipykernel==7.3.0
